En esta segunda película de la saga de las Tortugas Ninja, el malvado Shredder escapa de la muerte luego del enfrentamiento anterior, y esta vez tiene un único y perverso plan: acabar con las cuatro Tortugas. Para ello, hará uso de la sustancia mutágenica convirtiendo a dos criaturas que acaba de reclutar, los terribles e imponentes guerreros Rahzar y Tokka, que buscarán terminar con los superhéroes.
Es una tortuga mordedora mutante que fue creada por ordenes de Shredder, el cual utilizó la misma sustancia que mutó a las Tortugas Ninja originalmente.
Es un lobo gris mutante que, al igual que su compañero Tokka, fue creado por Shredder con el fin de vencer a las Tortugas Ninja que lo habían derrotado en el pasado.
Cuando Shredder es derrotado una vez más por las tortugas, decide utilizar el frasco de mutágeno en sí mismo, transformándose así en un Super Shredder, un ser gigante sin sentido y con una inmensa fuerza sobrehumana.
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